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    • CommentAuthorkatia
    • CommentTime20 Dec 2007
     
    Ciao a tutti, forse la mia domanda è banale ma la faccio lo stesso! Dopo aver lanciato una sequenza nucleotidica in blast (megablast o blastn), mi vengono dati alcuni valori riferiti alle sequenze che producono un allineamento significativo con la mia. Non capisco bene il significato del valore "E value" e quindi, sicuramente sbagliando, tendo sempre a non considerarlo.

    Qualcuno potrebbe spiegarmi? Grazie e Buone feste!!!
    • CommentAuthormorpheus
    • CommentTime21 Dec 2007
     
    In parole povere ...

    Lo SCORE = Indica quanto bene si appaiano le due sequenze (Più alto è, meglio è)

    L' E-VALUE = Indica quanto è statisticamente probabile che l'allineamento sia casuale (Più basso è, meglio è), E-VALUE sopra i 10-4 (0,0001) non sono da considerarsi interessanti.

    Spero di essere stato chiaro, se hai ancora domande postale !!!